專利局在收到申請人提交的實質審查請求書以及已有技術參考資料、實質審查費之后即對該專利申請進行實質審查，通常要檢索與發明主題有關的現有技術并對申請專利的發明是否屬于專利法所稱的發明、申請專利的發明是否違反國家法律、社會道德、公共利益、申請專利的發明是否屬于不授予專利權的領域。

申請專利的發明是否具備新穎性、創造性、實用性、是否符合同樣的發明創造只能被授予一項專利的規定、依照專利法第九條的規定，是否屬于最先申請人、說明書是否清楚完整地敘述了發明內容，說明書的撰寫是否符合規定。

以及權利要求書是否以說明書為依據，寫明了要求保護的范圍以及權利要求書的寫法是否符合規定、專利申請是否符合單一性的要求、申請人對其申請文件的修改或者分案，是否明顯超出了原說明書和權利要求書記載的范圍進行審查。

經過實質審查專利局認為不符合上述專利法規定的，即會以書面形式通知申請人，要求其在指定的期限內進行修改或陳述意見，申請人無正當理由期滿未答復的，其申請被視為撤回，申請人補正或陳述意見后，專利局仍然認為不符合上述規定的就會予以駁回并通知申請人，申請人不服駁回的可以向專利復審委員會請求復審。

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