一、目的的不同

　　計算機軟件著作權登記---屬于權利上的登記，目的在于確權，為今后追究第三方侵權留下足夠的證據;

　　軟件產品登記---目的在于投放市場，確保擁有一個合法的身份。

　　二、負責管理和登記的部門的不同

　　計算機軟件著作權登記部門為中國版權保護中心;

　　軟件產品登記：國內軟件產品登記由各省市軟件行業協會予以受理和認定。進口軟件產品(含進口軟件本地化產品)的登記申請，統一由中國軟件行業協會受理，最終經信息產業部審查批準后，核發軟件產品登記號和軟件產品登記證書。并由信息產業部審核備案。

　　三、保護期限的不同

　　軟件著作權自軟件開發完成之日起產生。自然人的軟件著作權，保護期為自然人終生及其死亡后50年，截止于自然人死亡后第50年的12月31日;軟件是合作開發的，截止于最后死亡的自然人死亡后第50年的12月31日。法人或者其他組織的軟件著作權，保護期為50年，截止于軟件首次發表后第50年的12月31日，但軟件自開發完成之日起50年內未發表的，本條例不再保護。

　　軟件產品登記保護期限為5年 。軟件產品登記的程序是 先有著作權證 和 相關營業執照 外加測試合格證書 才能進行產品登記。

　　著作權是你的權屬所在，是軟件開發完后可以自動 或 法律上登記程序而得到。

　　軟件產品登記是你具有了三證后，具有了軟件產品進入市場銷售的法律憑證。 (簡單點就是 銷售許可證)

　　1、計算機軟件著作權保護的對象是計算機軟件，不延及開發軟件所用的思想、處理過程、操作方法或者數學概念等。計算機軟件，指計算機程序及其有關文檔。軟件著作權登記工作是為貫徹著作權法的實施，適應著作權人和有關權利人的實際需要而設立的，這些工作在明確著作權人的合法權利等方面發揮著積極的作用。軟件著作權登記是辦理軟件產品登記的前提。

　　2、軟件產品實行登記和備案制度。未經軟件產品登記和備案或被撤消的軟件產品，不得在我國境內經營或者銷售。軟件產品經登記生效后，至2010年底以前，對增值稅一般納稅人銷售其自行開發生產的軟件產品，按17%的法定稅率征收增值稅后，對其增值稅實際稅負超過3%的部分實行即征即退政策。所退稅款由企業用于研究開發軟件產品和擴大再生產，不作為企業所得稅應稅收入，不予征收企業所得稅。軟件產品登記的有效期為五年，有效期滿后可申請續延。